Пустирник — рідкісне прізвище українського походження, утворене від слова “пустир” (необроблена, порожня земля, занедбана ділянка).
Пустирник — історична назва мешканця прикордонних, малозаселених земель (пустирів, українського степу), часто пов’язана з вільним козацтвом або особами, що жили поза осілими громадами.