1. Технологічний процес очищення води, ґрунту, стічних вод або повітря від забруднюючих речовин за допомогою живих організмів (бактерій, грибів, водоростей, рослин) або їхніх ферментів, що розкладають шкідливі сполуки на безпечні компоненти.
2. Сукупність методів біотехнології, спрямованих на нейтралізацію та утилізацію токсичних відходів промисловості та сільського господарства шляхом біологічної деструкції.