1. Біохімічний процес окиснення органічних речовин (нафти, вугілля, метану тощо) за участі специфічних мікроорганізмів, що призводить до їхнього розкладання або перетворення; біологічне окиснення.
2. У технології та охороні навколишнього середовища — метод очищення стічних вод, ґрунтів або повітря від органічних забруднювачів шляхом їхнього окиснення мікроорганізмами у спеціальних спорудах (біофільтрах, аеротенках).