Біофільтр — це технологічна споруда або пристрій для очищення стічних вод, повітря або газів, в якому основну роль відіграють мікроорганізми (бактерії, грибки, водорості), що осідають на поверхні спеціального завантаження (наприклад, керамзиту, щебеню, пластику) і розкладають органічні забруднювачі.
Біофільтр — це засипний матеріал (наприклад, пісок, гравій, керамзит) у системах очищення води, заселений співтовариством корисних мікроорганізмів, які фільтрують та біологічно переробляють шкідливі речовини.
Біофільтр — це пристрій в акваріумістиці, зазвичай ємність із пористим матеріалом, призначений для культивування нітрифікуючих бактерій, які перетворюють токсичні продукти життєдіяльності риб (аміак, нітрити) на менш шкідливі нітрати.