1. У молекулярній біології та генетиці — метод аналізу послідовностей ДНК або білків, що ґрунтується на пошуку віддалених гомологів (споріднених послідовностей) за допомогою ітераційного алгоритму, який значно підвищує чутливість порівняння з базами даних.
2. У математиці, зокрема в алгебричній топології та теорії гомологій — розширене поняття гомології, що виникає при вивченні спектральних послідовностей або як інваріант для складних просторів, де класичні гомологічні групи недостатньо інформативні.