Мікроценоз — сукупність мікроорганізмів (бактерій, грибів, найпростіших тощо), що населяють певне однорідне середовище (наприклад, ґрунт, воду, організм людини чи тварини) і пов’язані між собою та з цим середовищем комплексом взаємодій, формуючи екологічну систему (мікробіоценоз).