Агафонович — українське прізвище, що походить від імені Агафон, утворене за допомогою патронімічного суфікса -ович, який вказує на належність до батька (син Агафона).
Агафонович — поширене прізвище серед українських кобзарів та лірників, найвідомішим представником якого був Іван Кіндратович Агафонович (близько 1856–1926), сліпий кобзар із Чернігівщини, учень Остапа Вересая, виконавець дум та історичних пісень.