1. Спеціалізована колекція збережених зразків грибів (гербарних матеріалів, культур чи препаратів), що використовується для наукових досліджень, ідентифікації та освітніх цілей; аналог гербарію для вищих рослин.
2. Назва конкретної установи, колекції або фонду, що займається збиранням, зберіганням та вивченням мікологічних зразків (наприклад, Мікотека Інституту ботаніки ім. М. Г. Холодного).