1. Біохімічне перетворення однієї органічної сполуки в іншу за допомогою живих організмів (мікроорганізмів, рослинних або тваринних клітин, ферментів), що є основою метаболізму та часто використовується в промисловості та фармакології.
2. У фармакології та токсикології — процес метаболічної модифікації лікарських засобів або інших ксенобіотиків у організмі, що призводить до їхньої активації, інактивації або виведення.