1. Організм (бактерія, гриб, рослина тощо), який здатний перетворювати важкодоступні форми хімічних елементів (наприклад, важкі метали) на менш токсичні або легші для засвоєння іншими видами, виконуючи тим самим функцію природного очищувача в екосистемах.
2. Технологічний пристрій або система, в якій для переробки органічних відходів (наприклад, побутового сміття, осаду стічних вод) використовуються живі мікроорганізми, що продукують корисні речовини (біогаз, органічні добрива).