Анізоаутополіплоїд — організм або клітина, в яких набір хромосом є кратним основному гаплоїдному набору (тобто це поліплоїд), але поліплоїдія виникла внаслідок подвоєння власного геному (тобто це аутополіплоїд), причому кратні набори не є ідентичними через наявність хромосомних перебудов або анеуплоїдії (тобто вони “анізо-” або нерівні).